股东私下申请商标在公司名下可追究什么样的责任?

  他们已经构成了侵权。

  按照《刑法》规定构成了犯罪,挪用资金罪,你可以向公司所在地公安局的经侦部门举报,要求追究他们的刑事责任。

  建议你取得证据后先与他们协商,要求他们看在伙伴的份上,恢复到原状,实在不行就只能通过法律途径维权了。